Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ebi3O35228 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms