Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd9O35177 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nedd9O35177 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Nedd9O35177 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Nedd9O35177 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Nedd9O35177 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd9O35177 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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