Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl4M0QW46 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl4M0QW46 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms