Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms