Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17577J3QNF7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm17577J3QNF7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm17577J3QNF7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm17577J3QNF7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm17577J3QNF7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm17577J3QNF7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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