Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700014D04RikJ3QMS2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700014D04RikJ3QMS2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms