Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21746J3QMM6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21746J3QMM6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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