Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm21818J3KMS6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm21818J3KMS6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm21818J3KMS6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm21818J3KMS6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Gm21818J3KMS6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm21818J3KMS6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21818J3KMS6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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