Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms