Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms