Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CenpfE9Q3P4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpfE9Q3P4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms