Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Aldh3b2E9Q3E1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b2E9Q3E1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms