Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc175E9PVB3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms