Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl3E0CZ16 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms