Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms