Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2d4D3YUH6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms