Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5483B2RV77 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5483B2RV77 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms