Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms