Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdccag3A2AIW0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Sdccag3A2AIW0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms