Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700023F06RikA2AB62 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms