Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smurf2A2A5Z6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf2A2A5Z6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf2A2A5Z6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf2A2A5Z6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf2A2A5Z6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf2A2A5Z6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf2A2A5Z6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smurf2A2A5Z6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms