Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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