Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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Ccl20O89093 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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