Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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H2-Q1O19441 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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H2-Q1O19441 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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H2-Q1O19441 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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H2-Q1O19441 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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H2-Q1O19441 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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H2-Q1O19441 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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H2-Q1O19441 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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H2-Q1O19441 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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H2-Q1O19441 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-Q1O19441 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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