Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms