Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Top3bQ9Z321 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3bQ9Z321 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms