Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cog1Q9Z160 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog1Q9Z160 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms