Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne6Q9Z140 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms