Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms