Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx1Q9WV80 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx1Q9WV80 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms