Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pus1Q9WU56 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms