Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfwd2Q9R1A8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfwd2Q9R1A8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms