Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms