Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Irx4Q9QY61 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Irx4Q9QY61 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Irx4Q9QY61 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Irx4Q9QY61 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx4Q9QY61 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms