Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2e3Q9QXZ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2e3Q9QXZ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2e3Q9QXZ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2e3Q9QXZ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr2e3Q9QXZ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms