Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms