Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChmQ9QXG2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms