Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin3Q9JLB9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms