Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms