Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ybx3Q9JKB3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms