Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc12a4Q9JIS8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms