Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnmb4Q9JIN6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms