Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barx1Q9ER42 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms