Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox9Q9EQM5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox9Q9EQM5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox9Q9EQM5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox9Q9EQM5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox9Q9EQM5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox9Q9EQM5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms