Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf4Q9DAW6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4Q9DAW6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms