Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smco2Q9DA21 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms