Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calr3Q9D9Q6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms