Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms