Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Katnal2Q9D3R6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Katnal2Q9D3R6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms