Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snu13Q9D0T1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snu13Q9D0T1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snu13Q9D0T1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snu13Q9D0T1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snu13Q9D0T1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snu13Q9D0T1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snu13Q9D0T1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snu13Q9D0T1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snu13Q9D0T1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms